目的讨论甲巯咪唑（MMI）与丙硫氧嘧啶（PTU）治疗甲状腺功能亢进症（甲亢）患者的临床疗效和安全性。方法采用随机抽样法选择本院内分泌科2023年1月至2024年6月收治的160例患者，采用随机数字表法分为MMI组（80例，采用甲巯咪唑干预治疗）和PTU组（80例，采用丙硫氧嘧啶治疗）。疗程为12~18个月，辅助应用美托洛尔控制心率。对比两组患者治疗前后临床症状评分、甲状腺功能指标（FT3、FT4、TSH）、肝功能指标改善情况及不良反应发生率。结果治疗前，两组患者临床症状评分、甲状腺功能指标、肝功能指标对比差异无统计学意义（P>0.05）；治疗后，MMI组在临床症状改善方面优于PTU组（P<0.05）；MMI组患者FT3、FT4低于PTU组、TSH高于PTU组（P<0.05）；MMI组不良反应发生率显著低于PTU组（P<0.05）；MMI组的肝功能指标ALT、AST和TBIL水平优于PTU组（P<0.05）。结论分别采用甲巯咪唑与丙硫氧嘧啶治疗甲亢后，丙硫氧嘧啶的临床不良反应发生率高，治疗安全性较差，而甲巯咪唑不仅可对患者甲状腺功能产生积极影响，还可对应改善患者临床症状，治疗效果尤为突出，在临床中可将甲巯咪唑作为甲亢患者的首选治疗药物。