目的探讨深圳市罗湖区女性阴道微生态指标与高危型人乳头瘤病毒（HR-HPV）感染的相关性，为评估人乳头瘤病毒（HPV）感染风险提供潜在的微生物标志物。方法连续纳入2020年1月至2025年1月在深圳市罗湖医院集团医学检验中心同时进行HR-HPV基因分型（15种）检测及阴道微生态检测的9234名女性作为研究对象。收集人口学特征、HR-HPV感染状态及阴道微生态指标。采用单因素及多因素Logistic回归分析，评估各项阴道微生态指标与HR-HPV感染间的关联。结果在所有纳入对象中，阴道微生态失衡发生率为95.91%，HR-HPV总感染率为20.09%。单因素分析显示，阴道微生态失衡、pH值>4.5、过氧化氢、白细胞酯酶、霉菌孢子、线索细胞和镜检红细胞阳性在两组间的分布差异均具有统计学意义（P<0.05）。多因素Logistic回归分析进一步提示，线索细胞阳性是HR-HPV感染的独立危险因素（P<0.05），阴道微生态失衡、过氧化氢阳性、白细胞酯酶阳性及镜检红细胞阳性是HR-HPV感染的独立保护因素（P<0.05）。结论本研究提示，阴道微生态失与HR-HP感染存在显著关联，线索细胞阳性是其独立的危险因素。联合检测阴道微生态与HR-HPV，可能为宫颈癌筛查及感染风险分层提供有价值的辅助信息。