目的探讨肝硬化自发性细菌性腹膜炎（SBP）患者采用腹水宏基因组二代测序（mNGS）进行风险预测和预后预测的效果和意义。方法纳入2023年1月至2025年1月金华市人民医院收治的60例肝硬化腹水患者，入院时均予以腹水mNGS检测。按照腹水mNGS检测结果分为阳性组（23例）、阴性组（37例），比较两组患者基线资料、肝功能指标（Child-Pugh分级、MELD评分）。对全部患者进行为期1年的随访，对比两组SBP发生情况、病死率，采用多因素Logistic回归分析评估腹水mNGS对SBP风险预测的效果，采用Cox回归分析其对患者SBP预后的预测价值。结果两组患者一般资料对比差异无统计学意义（P＞0.05）。两组Child-Pugh分级比较差异具有统计学意义（P＜0.05），腹水mNGS阳性组Child-PughC级比例高于阴性组。腹水mNGS阳性组MELD评分高于阴性组（P＜0.05）。90d内腹水mNGS阳性组SBP发生率高于阴性组（P＜0.05）。随访1年内腹水mNGS阳性组SBP病死率高于阴性组（P＜0.05）。多因素Logistic回归分析显示，腹水mNGS阳性是SBP发生的独立危险因素。Cox回归分析显示，腹水mNGS阳性是1年全因死亡的独立预测因子（均P＜0.05）。结论腹水mNGS阳性是肝硬化腹水患者SBP发生的危险因素，可作为其早期风险评估的检查项目，且腹水mNGS与患者不良预后相关，能够有效预测肝硬化SBP患者预后结局。